修饰蛋白质组学之巴豆酰化鉴定

巴豆酰化是一种进化高度保守，且在生物学功能上完全不同于组蛋白赖氨酸乙酰化的蛋白质修饰方式。组蛋白巴豆酰化修饰是指在组蛋白的氨基酸残基上引入巴豆酰基团，参与基因表达调控等重要生物学过程。巴豆酰化蛋白质组以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象，目的在于鉴定样品中发生巴豆酰化的蛋白质以及相应的巴豆酰化位点。

一、技术特点：

（1）采用化学性质稳定巴豆酰化树脂IP的方法，特异性高，富集效率好；

（2）通过高分辨率、高扫描速度的质谱，对富集的巴豆酰化肽段进行大规模鉴定；

（3）结合常用的定量技术可对不同样品间的巴豆酰化水平差异进行定量比较。

二、适用范围：

（1）药物作用靶点研究；

（2）疾病标志物筛选；

（3）作用机制研究；

（4）物种蛋白质草图构建；

（5）要求已知物种基因组序列、ESTs序列或蛋白质序列全库。

三、实验流程：

（1）蛋白提取；

（2）肽段酶解；

（3）巴豆酰化肽段富集；

（4）HPLC分离；

（5）LC-MS/MS；

（6）数据解析；

（7）结果交付。

四、需提供：

（1）需鉴定的样品；

（2）样品信息：需详细说明样品来源、含量、状态及其他基本信息。

五、结果交付：

（1）实验报告一份，含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果（生物信息学分析）。

（2）生物信息学分析内容包括：

①修饰蛋白、修饰位点鉴定；

②鉴定结果特征分布：肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布；

③修饰位点motif预测；

④蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释；

⑤蛋白质网络互作预测（高级分析）；

⑥蛋白质Domain预测（高级分析）；

⑦蛋白质亚细胞定位（高级分析）。

六、实验周期：

自送样起40-60个工作日。