基因组学之16s、18s、ITS等扩增子测序

基因组研究包括两方面的内容：以全基因组测序为目标的结构基因组学（structural genomics）和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学（functional genomics)，又被称为后基因组（postgenome）研究，是系统生物学的重要方法。

在医学领域，基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法，有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域，基因组学的应用也十分广泛。基因组学的主要工具和方法包括生物信息学，遗传分析，基因表达测量和基因功能鉴定。

一、16s、18s、ITS等扩增子测序：

扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域，通过检测目标区域的序列变异和丰度，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。

二、技术优势：

1、通量高，适用于大量样本的特定基因组区域研究；

2、周期短，可缩短研究周期，加速临床应用及文章发表；

3、信息度高，针对感兴趣的基因组区域进行遗传变异位点的寻找，可对特定区域进行深入研究。

三、实验路线：

（1）样品准备；

（2）DNA提取与检测；

（3）PCR扩增；

（4）产物纯化；

（5）文库制备与产检；

（6）Hiseq上机测序。

四、生物信息学分析：

五、应用领域：

环境微生物、肠道微生物、发酵微生物菌群研究等。