修饰蛋白质组学之磷酸化鉴定

蛋白质磷酸化是生物体中最常见、最重要的一种蛋白质翻译后修饰方式，它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体的生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程，所以磷酸化一直是生物学研究的重点与热点。磷酸化蛋白质组（Phosphoproteomics）以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象，目的在于鉴定样品中发生磷酸化的蛋白质以及相应的磷酸化位点。

一、技术特点： （1）采用主流的IMAC富集方法，特异性高，富集效率好； （2）通过高分辨率、高扫描速度的质谱，对富集的磷酸化肽段进行大规模鉴定； （3）结合常用的定量技术可对不同样品间的磷酸化水平的差异进行定量比较。 二、适用范围： （1）药物作用靶点研究； （2）疾病标志物筛选； （3）植物胁迫/抗逆研究； （4）作用机制研究； （5）物种蛋白质草图构建； （6）要求物种含有已完成全基因组测序或转录组测序注释的CDS信息。 三、实验流程： （1）接受订单及样品； （2）肽段酶解； （3）磷酸化肽段富集； （4）HPLC分离； （5）LC-MS/MS； （6）数据解析； （7）结果交付。 四、需提供： （1）需比较的样品； （2）样品信息：需详细说明样品来源、含量、状态及其他基本信息。 五、结果交付： （1）实验报告一份，含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果（生物信息学分析）。 （2）生物信息学分析内容包括： ①修饰蛋白、修饰位点鉴定； ②鉴定结果特征分布：肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布； ③修饰位点motif预测； ④蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释； ⑤蛋白质网络互作预测（高级分析）； ⑥蛋白质Domain预测（高级分析）； ⑦蛋白质亚细胞定位（高级分析）。 六、实验周期： 自送样起50个工作日。