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转录组学之cirRNA测序

转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。 转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言,转录组测序无需预先设计探

基因组学之外显子组测序

基因组研究包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),又被称为后基因组(postgenome)研究,是系统生物学的重要方法。 在医学领域,基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法,有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域,基因组

基因组学之Hi-C测序

基因组研究包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),又被称为后基因组(postgenome)研究,是系统生物学的重要方法。 在医学领域,基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法,有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域,基因组

基因组学之单细胞测序

基因组研究包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),又被称为后基因组(postgenome)研究,是系统生物学的重要方法。 在医学领域,基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法,有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域,基因组

基因组学之16s、18s、ITS等扩增子测序

基因组研究包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),又被称为后基因组(postgenome)研究,是系统生物学的重要方法。 在医学领域,基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法,有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域,基因组

代谢组学服务简介(二)

“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能发生,而代谢组学则告诉你什么确实发生了”—Bill Lasley,UC Davis. 生命科学研究日新月异,基因组次及相关分析技术的提高极大地推动力转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表型组学等的快速发展,人们可以采用系统集成的手段,多层次揭示生命现象。这种研究的思路和方法催生了系统生物学。代谢组学是系统生物学的重要组成部分,代谢物与表型最为接近,代谢物的变化

靶向蛋白质组简介

靶向蛋白质组PRM(平行反应监测, Parallel Reaction Monitoring),是一种基于高分辨、高精度质谱的靶向定量技术,能够对目标蛋白质/肽段(以及含有修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段的精准定量。靶向蛋白质组扫描就像精准狙击,排除干扰,目标明确。 四级杆(Q1)首先选出的目标肽段离子,进入碰撞室中打碎后,所有的碎片离子经过质量分析器产生一张高分辨的二

IP-COIP检测常见问题与解答

一、IP、coIP的应用?免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)是利用抗原抗体特异性反应纯化富集样品中目的蛋白的一种方法。通常使目标蛋白同抗体-protein A/G形成免疫复合物沉淀而得以收集,然后通过WB检测目的蛋白。免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CO-IP)是将样品中同抗体靶蛋白相互作用的蛋白一同随免疫复合物沉淀,可以检测两种目标蛋白质是否在体内

酵母杂交常见问题与解答

一、该如何根据研究需求选择酵母单杂还是双杂?1) 酵母双杂交系统主要用于研究蛋白和蛋白之间的互作;2) 酵母单杂交系统主要用于研究DNA和蛋白之间的互作。 二、一般提到的酵母单双杂通用文库是什么意思?通过文库构建得到次级文库质粒,将文库质粒转化到Y187酵母宿主中,得到两种文库类型,可同时满足酵母单双杂公转筛库或酵母单双杂matting筛库。 三、酵母杂交具有什么样的优势?3.1从文库构建来说:①

蛋白质组全谱鉴定

蛋白质组(Proteome)指由一个物种或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱分析,可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。科沿有道基于高精度液质联用技术进行蛋白质全谱分析,可以对复杂样本进行蛋白种类分析,并进行相应的生物信息分析包括蛋白质的鉴定、GO分类和代谢通路的分析等,为蛋白质组学提供有力工具。一、技术特点: