Label free蛋白质谱简介

一、技术简介：

Label-free（蛋白质非标记定量技术）是通过LC-MS/MS技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用稳定同位素标签，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。 二、实验流程：

蛋白质样本—实验预判—Trypsin—LC-MS/MS—蛋白质定性定量—数据分析（*包括蛋白质定量、SDS-PAGE测试、酶解和质谱分析，对样本质量及样本之间的平行性进行初步判断） 。 三、技术优势：

1、无需昂贵的同位素标签做内部标准，实验耗费低； 2、对样本的操作少，从而使其最接近原始状态； 3、不受样品条件的限制，克服标记定量技术在对多个样本进行分析方面的缺陷； 4、对实验操作稳定性、重复性要求高，要求至少做三次生物重复。 四、应用方向：

1、农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；

2、 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；

3、 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；

4、生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；

5、微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；

6、海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；

7、 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；

8、食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。

五、数据分析：

1、蛋白质鉴定结果统计表；

2、蛋白质定量结果统计表；

3、GO功能注释统计表；

4、KEGG通路注释统计表；

5、蛋白质表达火山图；

6、差异表达蛋白质聚类分析；

7、差异表达蛋白质GO注释分析；

8、差异表达蛋白质KEGG通路分析；

9、KEGG通路图详细展示；

10、差异表达蛋白质构建蛋白质互作网络图。