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代谢组学服务简介(二)
“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能发生,而代谢组学则告诉你什么确实发生了”—Bill Lasley,UC Davis. 生命科学研究日新月异,基因组次及相关分析技术的提高极大地推动力转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表型组学等的快速发展,人们可以采用系统集成的手段,多层次揭示生命现象。这种研究的思路和方法催生了系统生物学。代谢组学是系统生物学的重要组成部分,代谢物与表型最为接近,代谢物的变化
小鼠下腔静脉深静脉血栓模型
一、目的: 建立实验室动物建模的标准操作规程。 二、适用范围: 本SOP适应于科沿有道实验室动物实验所有工作人员。 三、主体内容: 1.实验动物: 适应性饲养一周的健康C57bl/6小鼠,雌雄均可。 2.实验器械及物品准备:(所有物品消毒备用) 1)10%水合氯醛; 2)碘酒; 3)75%酒精; 4)常规手术器械
靶向蛋白质组简介
靶向蛋白质组PRM(平行反应监测, Parallel Reaction Monitoring),是一种基于高分辨、高精度质谱的靶向定量技术,能够对目标蛋白质/肽段(以及含有修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段的精准定量。靶向蛋白质组扫描就像精准狙击,排除干扰,目标明确。 四级杆(Q1)首先选出的目标肽段离子,进入碰撞室中打碎后,所有的碎片离子经过质量分析器产生一张高分辨的二
IP-COIP检测常见问题与解答
一、IP、coIP的应用?免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)是利用抗原抗体特异性反应纯化富集样品中目的蛋白的一种方法。通常使目标蛋白同抗体-protein A/G形成免疫复合物沉淀而得以收集,然后通过WB检测目的蛋白。免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CO-IP)是将样品中同抗体靶蛋白相互作用的蛋白一同随免疫复合物沉淀,可以检测两种目标蛋白质是否在体内
酵母杂交常见问题与解答
一、该如何根据研究需求选择酵母单杂还是双杂?1) 酵母双杂交系统主要用于研究蛋白和蛋白之间的互作;2) 酵母单杂交系统主要用于研究DNA和蛋白之间的互作。 二、一般提到的酵母单双杂通用文库是什么意思?通过文库构建得到次级文库质粒,将文库质粒转化到Y187酵母宿主中,得到两种文库类型,可同时满足酵母单双杂公转筛库或酵母单双杂matting筛库。 三、酵母杂交具有什么样的优势?3.1从文库构建来说:①
流式细胞术各项检测介绍
一、细胞周期检测: 检测要求:预冷的70%酒精固定的单细胞悬液:一周内均可检测。 未固定的新鲜细胞:2h内检测。 二、细胞凋亡检测: 检测范围:单细胞悬液。 样本形式:新鲜制备的单细胞悬液。 三、细胞增殖检测: 检测范围:人EDTA抗凝全血、悬浮细胞,要求样本无菌。 四、
蛋白质组全谱鉴定
蛋白质组(Proteome)指由一个物种或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱分析,可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。科沿有道基于高精度液质联用技术进行蛋白质全谱分析,可以对复杂样本进行蛋白种类分析,并进行相应的生物信息分析包括蛋白质的鉴定、GO分类和代谢通路的分析等,为蛋白质组学提供有力工具。一、技术特点:
比较蛋白质组学之iTRAQ定量分析
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是由AB SCIEX公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术,利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端和赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量,是近年来定量蛋白质组学中应用广泛的高通量筛选技术。一、技术特点:(1)自动化程度高:液
比较蛋白质组学之Label-free定量分析
Label-free是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同来源样品蛋白的数量变化,认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关。因此,蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。按照其原理主要分为两种,第一种spectrum counts类的非标记方法,发展比较早,已经形成多种定量算法。但是主要的原
动物造模——小鼠肾缺血再灌注模型SOP
一、目的: 建立实验室动物建模的标准操作规程。 二、适用范围: 本SOP适应于科沿有道实验室动物实验所有工作人员。 三、主体内容: 1.实验动物: 适应性饲养一周的健康大小鼠。 2.实验器械及物品准备(所有物品消毒备用): 1)干棉球,酒精棉球; 2)碘伏+棉签; 3)10%水合氯醛+注射器; 4)常规手术器械; 5)显微血管